El sistema milpa es una asociación entre cultivos que fueron domesticados por nuestros ancestros. Este sistema se originó hace más de 2,500 años, y se siembra principalmente maíz, frijol y calabaza. También se pueden sembrar plantas aromáticas, chile e incluso árboles frutales. Cada planta tiene un rol diferente, y colaboran entre sí para proveerse nutrientes y protegerse contra plagas y enfermedades.

El frijol es una leguminosa que tiene bacterias en sus raíces, estas son capaces de fijar el nitrógeno del aire y convertirlo en nitrógeno orgánico que pueden utilizar otras plantas. Básicamente, torna el suelo más fértil con la ayuda de bacterias. 

El maíz tiene la función de proveer soporte para el frijol, ya que este debe enredarse en alguna estructura vertical para tener un buen crecimiento. Además, es el principal sustento de miles de familias en Guatemala, tenemos decenas de variedades diferentes de maíz con resistencia a sequías y plagas. 

La calabaza es una planta rastrera con grandes hojas que cubren el suelo y generan sombra, esto evita que crezcan malezas que le quitan nutrientes a las demás plantas. Además, evitan que la luz del sol llegue al suelo, mantienen la humedad y reducen el uso del agua en el cultivo.